Alantrot kan brukes innvortes mot luftveisplager som bronkitt, forkjølelse, hoste, kikhoste, katarr, heshet, allergi, astma og lungelidelser som emfysem, lungebetennelse og tuberkulose. Ellers mot fordøyelsesplager som appetittløshet, kvalme, diaré, dysenteri, mye tarmgass, barneorm og andre tarmparasitter (bl.a. giardiasis, som er forårsaket av Giardia lamblia) og gjærsoppinfeksjoner (candida albicans). Preparater med alantrot har i folkemedisinen også vært brukt ved menstruasjonsplager, urinveisinfeksjoner, leverplager, hjertesykdommer, diabetes, hodepine og utmattelse.
Utvortes kan alantrot brukes i form av omslag som et antiseptisk middel ved hudsykdommer som skabb, herpes, akne og ulike utslett.